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Methoden & mehr
Molekularbiologie

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ExtraktionGeld sparenKlonieren
MutageneseOptogenetikProblemlösungen
ProteinanalytikSequenzierungTools
TransfektionTransformationTranslation
Trennen/Isolieren

Editing

Thumb
Neue Deko fürs Epigenom - Epigenetisches Editing art
Beim CRISPR/Cas9-basierten epigenetischen Editing modifizieren Biowissenschaftler die Struktur von Chromatin sowie Histonen, um die Expression einzelner Gene zu steuern. ... mehr
Thumb
Gene Editing mit Peptid-Nukleinsäuren art
Synthetische Peptid-Nukleinsäuren (PNAs) tragen Pyrimidin- und Purinbasen an einem Polyamidgerüst. Sie bilden mit Doppelstrang-DNA Triplehelices. Sie können damit gezielte Sequenzändeungen in die Original-DNA einbauen. ... mehr
Thumb
DNA-Origami art
DNA-Origami-Pionier Paul Rothemund bastelt aus DNA komplexe Strukturen. Man könnte Nanogefäße bauen, um Medikamente gezielt in Zellen zu bringen.... mehr
Thumb
Gene Drive art
Mittels Gene Drive lassen sich Mendelsche Regeln austricksen. Gentechnisch veränderte Mücken werden unempfindlich gegen Malaria-übertragende Parasiten. ... mehr
Thumb
Gene Editing in Zebrafischen mit CRISPR/Cas art
Mit dem CRISPR/Cas9-System lässt sich auch das Zebrafischgenom gezielt editieren.... mehr

Enzyme

Thumb
Computerprogramm für Restriktionsschnittstellen art
Computerprogramme, die für eine gegebene AS- oder DNA-Sequenz alle unterbringbaren Restriktionsschnittstellen nennen. Hier eine Auswahl.... mehr
Thumb
Iso- und Neoschizomere art
Isoschizomere und Neoschizomere sind Restriktionsenzyme, die die DNA-Sequenz unterschiedlich schneiden. ... mehr

Expression

Thumb
Thermoschalter für Proteinabbau art
Das It-Degron steuert einer temperaturabhängige Proteinabbau. Das It-Degron-Target-Fusionskonstrukt kann man durch PCR oder Gateway-Klonierung herstellen. Proteine lassen sich so gezielt an- oder abschalten.... mehr
Thumb
Pflanzliche Expressionssysteme art
Aus Weihnachtssternen lassen sich leicht Protoplasten isolieren, die als Produktionsstätte für rekombinante Proteine dienen... mehr
Thumb
Proteinexpression ohne IPTG art
Der Einsatz von E. coli-Stamm BL21-Gold (DE3) zur Expression von Fluoreszenz-Proteinen spart die Induktion durch IPTG und viel Optimierungsarbeit.... mehr
Thumb
Mikroplatten-Material beeinflusst Proteasom-Assays art
die Auswirkungen der verwendeten Reaktionsgefäße aus Plastik auf das jeweilige Experiment... mehr
Thumb
Abgestufte GFP-Expression art
die Expression von GFP und GFP-Fusionsproteinen lässt sich stufenweise bis auf das Niveau des endogenen Proteins absenken... mehr
Thumb
Expressionsplattform für große Proteinmengen art
Das Daedalus-Proteinexpressionssystem ist für die Herstellung großer Mengen rekombinanter Säugerproteine optimiert, z.B. für die Kristallisation.... mehr
Thumb
Expression von Multiproteinkomplexen art
Zur Expression von Multiproteinkomplexen kann man mehrere Gene in nur einem enzymatischen Schritt in ein Plasmid-Modul integrieren. ... mehr
Thumb
Bakterielle Protein-Expressionssysteme art
Alternativen zur bakteriellen Protein-Expressionssysteme mit E.coli... mehr
Thumb
Proteinseparation mit Affinität-Tags, Teil 1 art
Sechs Regeln für die ideale Isolierung rekombinanter Proteine ... mehr
Thumb
Proteinexpression in Säugerzellen art
Vergleich von Arbeitsaufwand, Preis und der gewonnener Menge Protein in verschiedenen Zellkultursystemen... mehr
Thumb
Vergleichstool zur Codon Usage art
Unterschiedliche Codon-Usage von Organismen kann zu Expressionsproblemen führen. Das Programm GCUA vergleicht die Codon-Usages der Organismen.... mehr

Extraktion

Thumb
Neue DNA-Reinigungskits von BIORON art
Das DNA-Aufreinigungsystem von BIORON basiert auf noch effektiver wirkenden Puffern und neuartigen Zentrifugationssäulchen mit optimaler DNA-Bindung.... mehr
Thumb
Plasmid-DNA-Extraktions-Kits art
Hier kommt ein ausführlicher Vergleich von Plasmid-DNA-Extraktionskids. Art der Aufreinigung werden ebenso aufgeführt, wie Ausbeute, Geschwindigkeit und Preis. Ein schneller und umfassender Überblick.... mehr
Thumb
Schaumfreie DNA-Extraktion art
Billig und schnell DNA extrahieren. Weglassen von SDS verhindert Schäumen, einmal Waschen mit Ethanol und der Einsatz von Isopropanol entfällt.... mehr
Thumb
Extraktion von gDNA aus Mikroorganismen art
Die EtNA-Methode zur Extraktion von Genomischer DNA aus gram-negativen und gram positiven Bakterien ist schonend, ohne Glaskügelchen.... mehr
Thumb
Chromosomen-Sieb art
Mit mehreren Filtrationsschritten kann man Chromosomen von den restlichen Zellbestandteilen trennen. Schnell, einfach und mit hoher Ausbeute.... mehr
Thumb
DNA-Extraktion aus Blättern art
Diese Extraktion genomischer DNA aus Blättern kommt ohne CTAB, PVP, Phenol und Proreinkinase A aus. Eine echte Alternative, auch zu DNA-Kits.... mehr

Geld sparen

Thumb
Luminometer selbstgebaut art
Die Luziferase von Photorhabdus luminescens kann Röntgenfilm schwärzen. Da kann man sich ein Luminometer selber bauen und spart mindestens 3000,-.... mehr
Thumb
Recycling von Agarosegelen art
Agarosegele sind recyclebar, einfach aufkochen. Sie sind 5-6 mal wiederverwendbar, für`s „einfach mal nachschauen“ völlig ausreichend... mehr

Klonieren

Thumb
Monarch DNA-Aufreinigungskits von New England Biolabs art
Monarch DNA-Aufreinigung von NEB für schnellere Protokolle, höhere Konzentrationen, maximale Performance & minimalen Umwelteinfluss durch das einzigartige Säulchen-Design.... mehr
Thumb
Konstruktion von Fusionsenzymen art
Diese Strategie ermöglicht die Herstellung von Multifusionsproteinen in vielen Vektorsystemen. Basis ist ein Klonierungssysem mit LguI und Eco81I. ... mehr
Thumb
Klonierungs-Kits art
Die traditionelle Restriktionsenzym-abhängige Klonierung ist sehr zeitaufwendig. Schneller und einfacher durchzuführen sind Ligase-unabhängige Klonierungsmethoden (LIC) wie Gibson-Assemblierung sowie Golden-Gate-Klonierung.... mehr
Thumb
Schneller Klonieren art
Die pHeaven´s Door-Klonierung kombiniert verschiedene Klonierungstechniken und spart so die aufwändige Gel-Reinigung. ... mehr
Thumb
Schnelle Ligation selbstgemacht art
Der Puffer: das Geheimnis der schnellen Ligation. PEG macht ihn viskos. Das erhöht die Rate mit der sich DNA-Enden treffen, binden und ligiert werden. ... mehr
Thumb
Restriktionsfreies (RF)-Cloning art
Die RF-Klonierung benötigt pro Fusionskonstrukt vier Primer. Daraus werden Megaprimer hybridisiert, die dann eingebaut werden können.... mehr
Thumb
Farbige Agarplatten art
Mit einfacher Lebensmittelfarbe kann man Platten mit verschiedenen Selektionsmarkern unterschiedlich färben ohne die Zellen zu beeinflussen.... mehr
Thumb
DNA-Verdau in der Mikrowelle art
Ein DNA-Verdau dauert zwei Runden in der Mikrowelle bei 600 Watt. Manchmal funktioniert das aber nicht. Es wird eine Testreihe empohlen.... mehr
Thumb
Koloniematerial mit dem Zahnstocher picken art
Mit einem sterilen Zahnstocher kann man Koloniematerial abnehmen und samt Zahnstocher direkt ins Kulturmedium werfen.... mehr
Thumb
Entsalzen von Plasmiden für die Elektroporation art
Lassen Sie Milipore-Filter auf destilliertem Wasser schwimmen, Plasmid-Lösung drauf geben – nach 15´ist das Salz weg difundiert.... mehr
Thumb
Verkürzte E. coli-Transformation art
Bei Routineklonierungen mit Plasmiden, die auf Ampicillin-Resistenz basieren können Sie auf die phänotypische Expression verzichten... mehr
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Three Way Ligations art
Probleme bei Ligationen in eng benachbarten Schnittstellen? Nehmen Sie doch noch eine dritte Schnittstelle dazu. Mehr Arbeit - besseres Ergebnis.... mehr
Thumb
Vektorreinigung mit Purification-Kits art
Vector und PCR-Produkt schneiden und mit PCR-Purification-Kit reinigen. Das aus dem Plasmid herausgeschnitte Fragment sollte kleiner als 75 bp sein... mehr

Mutagenese

Thumb
Kits für Mutagenese und Genom Editierung art
Die Overlap-Extension-PCR verwenden Molekularbiologen seit Ende der achtziger Jahre in verschiedenen Varianten für die zielgerichtete Mutagenese. Moderne Editierungs-Techniken CRISPR-Cas, TALEN sowie ZNF basieren auf dem präzisen Abbau der Zielgene durch eine Nuklease. Bei TALEN und ZNF wird die Nuklease von Proteinen zu ihrem Ziel geführt, bei CRISPR-Cas9 durch die sgRNA. ... mehr
Thumb
Mutagenese mit TA-Strategie art
Es entsteht ein linearisierter Vektor dem die zu mutierende Base fehlt. So kann man über ein synthetisiertes Oligo die gewünschte Mutation einfügen.... mehr
Thumb
Mutagenese unphosphoryliert und unligiert art
Mit dieser, hausgemachten Mutagenese kann man in Plasmide Basenaustausche, Deletionen oder Insertionen von wenigen Nukleotiden einführen. ... mehr
Thumb
Zielgerichtete Mutagenese mit thermostabilen DNA-Polymerasen art
thermostabile DNA-Polymerasen zeigen ihre wahre Stärke bei PCR-basierten Mutagenesen ... mehr
Thumb
Zielgerichtete Mutagenese mit thermolabilen DNA-Polymerasen art
Die Ausbeuten bei der Primer-Extension-Mutagenese sind oft bescheiden, aber es gibt zahlreiche Tricks, wie man sie erhöhen kann... mehr

Optogenetik

Thumb
Neue Optogenetische Werkzeuge art
Optogenetiker bauen Photosensoren in Proteine ein, um sie mit Lichtimpulsen an- und ausschalten zu können. ... mehr

Problemlösungen

Thumb
PCR-Alternative art
Isotherme Amplifikations-Methoden vervielfältigen DNA auch ohne PCR. Besonders lange DNA-Sequenzen können damit ohne Bias vermehrt werden.... mehr
Thumb
Kartierungsverfahren art
Die Kartierung von Genen ist auf vielerlei Methoden möglich. Unser Überblick erklärt, wie sie funktionieren und welche ideal für Ihre spezielle Fragestellung ist.... mehr
Thumb
DNA-Konzentrationsbestimmungen mit dem Photometer II art
Auch der pH-Wert kann sich störend auf die OD-Messung auswirken.... mehr
Thumb
Optimierung bekannter Routinemethoden art
Experimentelle Kostbarkeiten zur Optimierung von Routine-Labormethoden... mehr
Thumb
UV-Licht in der Zellkultur art
Es gibt verschiedene Möglichkeiten die Funktionsfähigkeit Ihrer UV-Leuchten zu messen.... mehr
Thumb
DNA-Konzentrationsbestimmungen mit dem Photometer I art
Der Mehrfachmessungs-Trick ist eine einfache Methode, Fehler bei der OD-Bestimmung zu vermeiden... mehr
Thumb
Reinigung von dsDNA mit Guanidinhydrochlorid art
Wie kann man die Gel-Auftrennung umgehen? Im Prinzip benötigt man nur QIAGENs Qiaquick PCR Purification-Kit und etwas Guanidinhydrochlorid.... mehr
Thumb
Verblüffende Hintergrund-Infos art
Es ist nicht geklärt, ob Ethidiumbromid durch Handschuhe diffundiert. In den 1950er Jahren wurde EtBr zur Bekämpfung der Trypanosomose verwendet. ... mehr
Thumb
Allgemeines und Spezielles art
Ethidiumbromid ist giftig und krebserregend, und die Entsorgung ist kompliziert. Doch ungefährliche Alternativen wie SYBR green sind extrem teuer. ... mehr

Proteinanalytik

Thumb
Biochemische Routinemethoden, Teil 1 art
drei Beispiele wie man mit verblüffend einfachen Mitteln große Wirkung bei der Proteinanalyse erzielen kann... mehr

Sequenzierung

Thumb
Next-Generation-Sequenzing-Plattformen art
Mit Hilfe von barkodierten DNA-Fragmenten lassen sich aus den kurzen Reads üblicher NGS-Sequenzierer synthetische lange Reads erzeugen, die für Assemblierungsprogramme leichter auszuwerten sind. Viel einfacher erhält man lange Reads jedoch mit Einzelmolekül- sowie Nanoporen-Sequenzierern, die Leselängen bis über 200 Kb erreichen. ... mehr
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Verbesserte Nanoporensequenzierung art
Nanoporensequenzierung ist kostengünstig, aber ungenau. Neuartige Poren bringen Abhilfe, doch bis zur fehlerfreien de-novo-Sequenz ist es noch weit.... mehr
Thumb
Kits zur Herstellung von NGS-Bibliotheken art
Mit einem NGS Library Preparation-Kits trimmt man die Enden fragmentierter DNA und fügt entsprechende Adapter an, die zur Chemie der gewählten Sequenzierplattform passen. PCR-freie Kits enthalten einen Enzym-Mix der für eine sehr effiziente Ligation der Plattform-spezifischen Adaptersequenzen an die beiden Enden der DNA-Fragmente sorgt.... mehr
Thumb
Basen-Bias vermeiden art
NGS-Sequenzierung erzeugt bei hohen AT- und GC-Anteilen oft Artefakte und Sequenzierfehler. Raffinierte PCR-Tricks vermeiden dies.... mehr
Thumb
Fast Isogenic Mapping art
Fast Isogenic Mapping-by-Sequencing verkürzt die Suche nach kausalen Genmutationen um Wochen oder Monate.... mehr
Thumb
Modifizierte Sanger-Sequenzierung art
Beim Sequenzieren kann man die arbeitsintensiven Reinigungsschritte oft verkürzen oder einfach weglassen.... mehr
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Sanger-Sequenzanalyse art
Im Jahr 2004 ist die Methode der Wahl die Sequenzierung nach Sanger.... mehr
Thumb
Grundsätzliches und Philosophisches art
Ohne Hybridisierungen ist die moderne Molekularbiologie nicht denkbar. Hier erfahren Sie mehr über die Hintergründe sowie allerhand Hintergründiges.... mehr
Thumb
Kapillare Sequenzierung ohne Radioaktivität art
Die radioaktive Sequenzierung ist längst out – Kapillar-Sequenzierer liefern dank Markierung mit Fluoreszenz-Farbstoffen schnell und einfach Ergebnisse.... mehr
Thumb
Klassische Methoden sind optimierbar art
Althergebrachte Hybridisierungs-Protokolle lassen sich optimieren. Durch Variation oder Weglassen bestimmter Versuchs-Schritte erhält man bessere Resultate.... mehr

Tools

Thumb
Histon-Modifikation mit Inteinen art
Eine neue Split-Intein-Technik zur Modifikation von Histonen ergänzt bestehende Methoden der Chromatin-Analyse und eröffnet neue Wege zur Epigenetik.... mehr

Transfektion

Thumb
Wasser-in-Öl Elektroporation art
Die Wasser-in-Öl Elektroporation ist erschwinglich und funktioniert. Plasmid-DNA gelangt durch schnellen Polaritätswechsel in die Zellen.... mehr
Thumb
Reportergen-Assay-kits art
Viele Reportergen Assay-Kits nutzen die durch die Luciferase katalysierte Oxydation des Substrates Luciferin zu Oxyluciferin. Neben AMP, Pyrophosphat und Kohlendioxid entsteht bei dieser auch ein kurzlebiger, gelb lumineszierender Lichtblitz.... mehr
Thumb
Lipofektionseffizienz gesteigert art
Die Effizienz der Lipofektion lässt sich steigern, indem man die Zellen vorher suspendiert und nach der Transfektion wieder ausplattiert... mehr
Thumb
Transfektion art
Es existieren zahllose Transfektionsmethoden und -Reagenzien. Wir stellen die wichtigsten vor.... mehr

Transformation

Thumb
Transformation mit Schockwellen art
Wenn Zellen sich partout nicht transformieren lassen, können Schockwellen helfen.... mehr

Translation

Thumb
Codonsonne neu geordnet art
Die Codon-Sonne neu geordnet. In der Mitte steht jetzt die zweite Base. Der Effekt: Funktionell und strukturell ähnliche Aminosäuren rücken zusammen.... mehr

Trennen/Isolieren

Thumb
Geltransport mit Katzenschaufel art
Einfacher Transport von Gelen mit einer Katzenschaufel, Sicher und sauber gerade beim Umgang mit Ethidiumbromid... mehr
Thumb
Weiße PAGE-Gele art
Einlegen in Ethanol verhindert das verschwinden der Banden, färbt das Gel weiß, lässt es etwas schumpfen und lässt es leichter trocknen.... mehr
Thumb
Entsalzen im Eppendorfgefäß - Mikrodialyse art
Ein 0,2 ml PCR-Gefäß, Spitze abschneiden, 0,5 ml Eppi mit Reinstwasser, Dialyse-Schlauch drüberlegen und PCR-Gefäß reischieben, Probe in PCR-Gefäß.... mehr
Thumb
Herstellung konzentrierter Agarose-Gele art
Herstellung konzentrierter Agarosegele zur Trennung von kurzen DNA-Fragmenten, 3%-5%, aus einfacher LE-Agarose. Einfache und günstige Methode... mehr
Thumb
UV-Transilluminatoren richtig verwenden art
Hier gibt’s Tipps wie man sicher mit UV-Transilluminatoren arbeitet. So vermeiden Sie Sonnenbrand, zerkratzte Scheiben und geringe Sensitivität.... mehr
Thumb
Methylenblau-Färbung von DNA art
Die Methylenblau-Färbung ist eine Haut- und Augenschonende Alternative zur Ethidiumbromid-Färbung, wenn auch mit geringerer Empfindlichkeit.... mehr
Thumb
Eluieren von Midipräps mittels Vakuum art
Ein selbstgebauter Vakuum-Eluator holt DNA aus dem Midi-Präp, viel effizienter als Zentrifugation und sehr viel billiger ... mehr
Thumb
UV-Schutz aus Plexiglas art
Eine Plexiglesscheibe über dem UV-Leuchttisch angebracht, verhindert einen Sonnenbrand. Die Institutswerkstatt hilft.... mehr
Thumb
Sonenbrand vom UV-Leuchttisch art
Beim Ausschneiden von DNA-Banden auf dem UV-Leuchttisch fängt man sich schnell einen heftigen Sonnenbrand. Aspirin hilf. Wie weiß man nicht.... mehr
Thumb
Winzige DNA-Pellets einfach wieder finden art
Für FISH gefällte DNA ist meistens als winziges Pellet schwer zu finden. Eine Färbung mit Dextranblau hilft beim finden und stört später nicht.... mehr
Thumb
Klonierungen ohne UV-Schäden art
Der Trick mit den zwei Agarosegel-Spuren: Wie kann man DNA-Banden ohne UV-Strahlung finden und ausschneiden? Hier steht´s.... mehr
Thumb
Restriktionsverdaute DNA-Fragmente trennen art
Die DNA-Ausbeute eines Verdaus erhöhen, indem man die Schritte Gel- bzw. Phenol/Chloroform-Extraktion und Auftrennung durch ein Gel vertauscht. ... mehr
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Elution von DNA-Fragmenten art
Sie können DNA in einem Polyacrylamid-Gel direkt in ein eingestecktes Stück Nitrocellulose laufen lassen, oder einfach rauskratzen.... mehr
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Freeze & Squeeze - DNA aus Gelen quetschen 1 art
Einfrieren und Auftauen, so lässt sich DNA aus ausgeschnittenen Agarosegel-Banden einfach und billig herauslösen. Bilig und schnell.... mehr
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Northern-/Southernblots Bandenfärbung art
Optimal gefärbte Banden bei Northern-Blot und Southern-Blot erhält man mit niedriger Stringenz, aber ausdauerndem Waschen und einem Saugpapier... mehr
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Freeze & Squeeze - DNA aus Gelen quetschen 3 art
Wer hat´s erfunden? Eine kleine Geschichte der Freeze and Squeeze-Methode. Zusätzlich eine Alternative die ohne Einfrieren und Phenol auskommt.... mehr
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Freeze & Squeeze - DNA aus Gelen quetschen 2 art
Auch größere DNA-Fragmente lassen sich mit dieser Methode aus dem Gel lösen. Sauberer als die Freeze- , einfacher als die Zentrifugaionsmethode.... mehr
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DNA-Reinigung mit chaotropen Salzen art
Die molekular-/physikalisch-chemischen Grundlagen der DNA-Aufreinigung mittels Glasmilch beziehungsweise Silica-Membran-Kits werden verständlich erklärt.... mehr


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