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Produktübersicht: Liquid-Handling-Automaten für die Nukleinsäure-Extraktion nutzen meist Silika-Säulen oder magnetische Beads für die Extraktion von DNA oder RNA

Methode: Geräte für die Elektroelution von RNA aus Poly­acrylamid-Gelen sind recht unterschiedlich konzipiert. Sie funktionieren aber dennoch gleich gut.

Methode: RNA mit Phenol/Chloroform zu extrahieren, ist nicht ganz ungefährlich. Schonender für Umwelt und Experimentator ist Ammonium­trichloracetat.

Methode: Mit individuell anpass­baren DNA-Nano­schaltern lassen sich RNA-Spezies fast schon kinderleicht einfangen und isolieren.

Trick: RNA wird häufig mit Phenol extrahiert, das die Bestimmung der RNA-Konzentration stören kann. Im Gegensatz zu üblichen UV/Vis-Spekrometern

Produktübersicht: Forscher extrahieren RNA entweder mit der Trizol-Methode, die auf der RNA-Ex­trak­tion mit saurem Phenol basiert, oder mit RNA-Ex­trak­tions-Kits,

Methode: Die Silica-Oberflächen kleiner Spin-Säulchen für die RNA-Extraktion ziehen RNA magisch an. Manchmal so stark, dass sie schon vor der Extraktion im Labor mit RNA verunreinigt sind.

Methode: Bei der Suche nach RNA-bindenden Proteinen fallen viele hinten runter, die an kleine RNAs binden. Eine neue Extrak­tionstechnik verhindert das.

Methode: Übliche Fluoreszenz-Label für RNA können dessen Transkription und Translation stören. Ein neues Label schleicht sich jedoch unbemerkt in die RNA ein.

Trick: FDF-PAGE verhindert das wegfischen von sRNA durch endogene ceRNA. Vollständige Denaturierung trennt ceRNA und sRNA. Quantifizierung möglich.

Methode: der Nachweis von mRNA viele Tücken hat, die RNAscope-Methode eliminiert nahezu alle Störsignale.

Trick: Mit diesem Assay kann man miRNA-Ziele finden. Das funktioniert über eine cDNA-Bibliothet aus der RNA und Resistenzgenen gegen Zeocin und Ganciclovir.

Trick: Die Expressionslevel von miRNAs messen mit RCA. Sequenzspezifische gequenchte Staudinger-getriggerte Fluoreszenz-Proben (Q-STAR) als Nachweis.

Trick: Das Dicer-Enzym des Flagellaten Giardia lambliazur Herstellung eines siRNA-Pools. Es lässt sich leicht exprimieren, ist schnell und robust.

Trick: Crosslinking von kleinen RNAs mit EDC an eine Nylonmembran erleichtern den Zugang der Hybridisierungs-Probe beim Northern Blot.

Trick: Eine siRNA durch DICER Behandlung von in vitro transkribierter dsRNA. MIt einemTrick lässt sich das Rneasy-Kit für die Reinigung von siRNA benutzen.

Trick: RNA aus Pankreas, Thymus oder Milz: das Gewebe schnell und gründlich homogenisieren und lieber nicht in Wasser lösen.

Methode: Lange, nichtcodierende RNAs (lncRNAs) sind alles andere als nutzloser Müll. Viele lncRNAs binden an Transkriptionsfaktoren und regulieren so die Expression von Genen. Eine neue Technik erleichtert die Suche nach ihren Interaktionspartnern.

Methode: microRNAs dirigieren das Effektorprotein Argonaut (Ago) zu einem komplementären Abschnitt in der 3'-Untranslatierten Region einer Ziel-mRNA. Bei der Ago-TRIBE-Technik fusioniert man Ago2 mit der Deaminase ADAR2. Nach der Sequenzierung der RNA kann man die mRNA-Abschnitte identifizieren an die das Ago2-ADAR2-Fusionsprotein gebunden hat.

Methode: Mit dem neuen Halo-Enhanced Ago2-Pulldown-Assay lassen sich Ziel-mRNAS von miRNAs auch in vivo bestimmen

Trick: Mit speziellen Lipid-Nanopartikeln lassen sich siRNAs sehr flexibel in gewünschte Zielzellen einschleusen.

Produktübersicht: Für die RNA-Sequenzierung ist eine tadellose Sequenzier-Bibliothek Voraussetzung. Den passenden RNA-Seq-Kit zu finden,

Methode: Trotz detaillierter Einzelzell-Analyse müssen ab und an auch ganze Zellpopulationen sequenziert werden. Das Prime-seq-Protokoll spart dabei viel Geld.

Methode: Genaue und Hochdurchsatz-geeignete SARS-CoV-2-Nachweisverfahren auf Basis des Next Generation Sequencing könnten

Methode: Bei der Einzelzell-RNA-Sequen­zierung werden die Zellen mit einem Barcode versehen, um die von ihnen stammenden Transkripte

Methode: Um bei der Einzelzell-RNA-Sequen­zie­rung einen unverfälschten Schnappschuss des Transkriptoms zu erhalten, kann man es mit Glyoxal fixieren.

Methode: Mit der ursprünglich für DNA-Methylierungsanalysen entwickelten Single Nukleotid Primer Extension (SnuPE)-Technik kann man sehr schnell bekannte SARS-CoV-2-Varianten

Methode: Bei einem neuen RNA-seq-Protokoll kann man sich die Extraktion der RNA sparen. Die cDNA wird direkt im Lysat synthetisiert.

Methode: In den letzten zehn Jahren machte die Einzelzell-Analyse erstaunliche Fortschritte. Ihr neuester Coup ist die räumlich aufgelöste Transkriptomik,

Methode: Um an genetisches Material für die RNA-Seq zu kommen, sollten Pflanzen­forscher die RNA besser direkt aus den Zellkernen extrahieren statt aus den Protoplasten.

Methode: Mit dem LAMP-Seq Nachweisverfahren sind SARS-CoV-2-Massentests möglich. Da die Virus-RNA mit einer Sequenzierung nachgewiesen wird,

Methode: Proben für die RNA-Sequenzierung sollten keine ribosomale RNA enthalten. Mit einem DIY-Kit lässt sich diese ganz einfach und kostengünstig dezimieren.

Produktübersicht: miRNA-Expressionsprofil-Plattformen, detektieren miRNAs zumeist mittels RT-qPCR, miRNA-Microarrays oder miRNA-Se­quen­zie­rung (RNA-Seq).