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Sequenzierung


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Extraktion

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art Forscher extrahieren RNA entweder mit der Trizol-Methode, die auf der RNA-Extraktion mit saurem Phenol basiert, oder mit RNA-Extraktions-Kits, die kleine Silica-Spin-Säulen für die Festphasen-Extraktion von RNA enthalten. Extraktions-Kits liefern zumeist ausreichend reine RNA mit guten Ausbeuten. De... mehr

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Handling

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art FDF-PAGE verhindert das wegfischen von sRNA durch endogene ceRNA. Vollständige Denaturierung trennt ceRNA und sRNA. Quantifizierung möglich.... mehr

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art der Nachweis von mRNA viele Tücken hat, die RNAscope-Methode eliminiert nahezu alle Störsignale.... mehr

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art Mit diesem Assay kann man miRNA-Ziele finden. Das funktioniert über eine cDNA-Bibliothet aus der RNA und Resistenzgenen gegen Zeocin und Ganciclovir.... mehr

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art Die Expressionslevel von miRNAs messen mit RCA. Sequenzspezifische gequenchte Staudinger-getriggerte Fluoreszenz-Proben (Q-STAR) als Nachweis.... mehr

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art Das Dicer-Enzym des Flagellaten Giardia lambliazur Herstellung eines siRNA-Pools. Es lässt sich leicht exprimieren, ist schnell und robust.... mehr

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art Crosslinking von kleinen RNAs mit EDC an eine Nylonmembran erleichtern den Zugang der Hybridisierungs-Probe beim Northern Blot. ... mehr

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art Eine siRNA durch DICER Behandlung von in vitro transkribierter dsRNA. MIt einemTrick lässt sich das Rneasy-Kit für die Reinigung von siRNA benutzen.... mehr

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art RNA aus Pankreas, Thymus oder Milz: das Gewebe schnell und gründlich homogenisieren und lieber nicht in Wasser lösen. ... mehr

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art Lange, nichtcodierende RNAs (lncRNAs) sind alles andere als nutzloser Müll. Viele lncRNAs binden an Transkriptionsfaktoren und regulieren so die Expression von Genen. Eine neue Technik erleichtert die Suche nach ihren Interaktionspartnern. ... mehr

Sequenzierung

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art miRNA-Expressionsprofil-Plattformen, detektieren miRNAs zumeist mittels RT-qPCR, miRNA-Microarrays oder miRNA-Sequenzierung (RNA-Seq). Über den Daumen gepeilt, ist die ­miRNA-Seqenzierung die teuerste aber auch exakteste Methode; miRNA-Microarrays sind günstig, aber eher unspezifisch. Die preislich ... mehr