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Methoden & mehr
RNA

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Sequenzierung

Extraktion

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RNA-Extraktions-Kits art
Forscher extrahieren RNA entweder mit der Trizol-Methode, die auf der RNA-Extraktion mit saurem Phenol basiert, oder mit RNA-Extraktions-Kits, die kleine Silica-Spin-Säulen für die Festphasen-Extraktion von RNA enthalten. Extraktions-Kits liefern zumeist ausreichend reine RNA mit guten Ausbeuten. Deutliche Unterschiede gibt es jedoch bei den RNA-Integritätszahlen.... mehr

Handling

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Vollständig Denaturierende Formaldehyd PAGE art
FDF-PAGE verhindert das wegfischen von sRNA durch endogene ceRNA. Vollständige Denaturierung trennt ceRNA und sRNA. Quantifizierung möglich.... mehr
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RNA-Detektion via RNAscope art
der Nachweis von mRNA viele Tücken hat, die RNAscope-Methode eliminiert nahezu alle Störsignale.... mehr
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miRNA-Ziele finden art
Mit diesem Assay kann man miRNA-Ziele finden. Das funktioniert über eine cDNA-Bibliothet aus der RNA und Resistenzgenen gegen Zeocin und Ganciclovir.... mehr
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miRNA Detektion art
Die Expressionslevel von miRNAs messen mit RCA. Sequenzspezifische gequenchte Staudinger-getriggerte Fluoreszenz-Proben (Q-STAR) als Nachweis.... mehr
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siRNA-Pool mit Geißeltier-Häcksler art
Das Dicer-Enzym des Flagellaten Giardia lambliazur Herstellung eines siRNA-Pools. Es lässt sich leicht exprimieren, ist schnell und robust.... mehr
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Nachweis kleiner RNAs mit Northern Blot art
Crosslinking von kleinen RNAs mit EDC an eine Nylonmembran erleichtern den Zugang der Hybridisierungs-Probe beim Northern Blot. ... mehr
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Einfache und effektive Aufreinigung von siRNA art
Eine siRNA durch DICER Behandlung von in vitro transkribierter dsRNA. MIt einemTrick lässt sich das Rneasy-Kit für die Reinigung von siRNA benutzen.... mehr
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RNAse Inhibitoren bei RNA aus schwierigen Geweben? art
RNA aus Pankreas, Thymus oder Milz: das Gewebe schnell und gründlich homogenisieren und lieber nicht in Wasser lösen. ... mehr

Sequenzierung

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Plattformen für die Herstellung von miRNA-Expressionsprofilen art
miRNA-Expressionsprofil-Plattformen, detektieren miRNAs zumeist mittels RT-qPCR, miRNA-Microarrays oder miRNA-Sequenzierung (RNA-Seq). Über den Daumen gepeilt, ist die ­miRNA-Seqenzierung die teuerste aber auch exakteste Methode; miRNA-Microarrays sind günstig, aber eher unspezifisch. Die preislich dazwischen liegenden miRNA-qPCR-Plattformen sind sehr sensitiv und spezifisch.... mehr


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