Info

Tipp 83:
Probieren Sie doch mal FISH blau!
Winzige DNA-Pellets einfach wieder finden

Info

Info

Bestellen Sie noch heute Ihr kostenfreies Exemplar. mehr


Na, wo ist es denn? Gar nicht so einfach zu sagen, wenn das DNA-Pellet stecknadelklein irgendwo und unerkannt im Reaktionsgefäß klebt. Mit dem nachfolgenden Lesertipp finden Sie es problemlos wieder.

Nicht nur bei der Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) gilt: Das Suchen nach dem verflixten DNA-Pellet gleicht manchmal dem sprichwörtlichen Aufstöbern von Stecknadeln in Heuhaufen. Ulrike Gamerdinger vom Institut für Pathologie des Universitätsklinikums Gießen weiß Abhilfe: Sie schlägt hier einen simplen Trick vor, der sich in etwa mit "FISH blau" umschreiben lässt:


"Wenn man seine DNA-Sonden für die FISH selber markiert, sieht man sich anschließend damit konfrontiert, diese zu fällen, um sie anschließend in einem Hybridisierungspuffer aufzunehmen. Die gefällte DNA findet sich in der Regel als etwa stecknadelkopfgroßes Pünktchen am Grunde eines Reaktiosgefäßes. Ist diese dann noch getrocknet, ist sie relativ schwierig zu sehen. Was tun?

Info

Info

Neuer Mehrfachdispenser von BRAND: Das moderne Touch-Bedienkonzept macht die Arbeit einfach und effizient. mehr


Um das DNA-Pellet besser begutachten zu können, kann dem zu fällenden DNA-Ansatz Dextranblau als Farbstoff zugesetzt werden. Ein Ansatz zur DNA-Fällung sieht dann beispielsweise folgendermaßen aus:
  • x µl DNA-Sonde 1
    (y µl DNA-Sonde 2, z µl DNA-Sonde 3, ...)
  • 10 µl Cot1
  • 3 µl salmon testis-DNA
  • 5 µl Blaumarker
  • 10 % des Vol. Natriumacetat
  • 2,5 x Vol. absoluter Alkohol
(Blaumarker: 0,5 % Dextranblau, 0,1 M NaCl, 20 mM EDTA, 20 mM Tris pH 7,8)



Info

Info

Info

Pipettieren, lagern und zentrifugieren Sie Proben in unserem Spiel "Master of Volumes" so schnell wie möglich. mehr



Die gefällte DNA zeigt sich nach dem Abzentrifugieren als blaues Pellet. Auch getrocknet ist es noch gut sichtbar und das anschließende sich lösen der DNA-Sonde lässt sich gut kontrollieren. Darüber hinaus hat der Hybridisierungsansatz eine leicht bläuliche Färbung, die auch beim Auftragen auf den Objektträger hilfreich ist. Eine Beeinträchtigung der Hybridisierung durch den Farbstoff konnte ich noch in keinem Fall feststellen. Ich hoffe, dieser Tipp ist für einige Laborjournal-Leser hilfreich."

Ulrike Gamerdinger
(Institut für Pathologie,
Universitätsklinikum Gießen)







Letzte Änderungen: 25.07.2005


Diese Website benutzt Cookies. Wenn SIe unsere Website benutzen, stimmen SIe damit unserer Nutzung von Cookies zu. Zur ausführlichen Datenschutzinformation