Seit das neue Coronavirus begann, sich seinen Weg durch die Weltbevölkerung zu bahnen, verändert es sich ständig. Wie man es von einem ordentlichen Virus erwartet, tauscht es einzelne Basen aus und verliert auch mal ein paar. Umgangssprachlich ist dann von Virusmutanten die Rede, biologisch korrekt würde man – je nach der Stärke der Veränderung – von neuen Linien, Subtypen oder Genotypen sprechen.
Über 12.000 Veränderungen sammelte SARS-CoV-2 seit seiner Entdeckung in Wuhan vor gut einem Jahr an. Etwa ein Drittel sitzt im Gen für das Spike-Protein, mit dem das Virus sich an den menschlichen ACE2-Rezeptor ankoppelt. Veränderungen dort haben das Potenzial, das Virus infektiöser zu machen.
Aktuell macht sich B.1.1.7 (die „britische Mutante“) in Europa breit, B.1.1.28 in Südamerika. Woher wissen wir das und wie kommen eigentlich diese kryptischen Bezeichnungen zustande?
Virus-Ordnung in Datenbanken
In Wuhan hatte man es mit zwei Virusvarianten zu tun, die man in die Linien A und B einteilte. Auf diesem System basierend entwickelte sich die heute gültige Nomenklatur für SARS-CoV-2-Genotypen (Nature Microbiol, 5:1403-7). Bis heute führt man alle Varianten auf die Vorfahren von Typ A oder B zurück.
Die Sequenzen sind – soweit bekannt – in etlichen Datenbanken dokumentiert, auch in GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data), einer in Deutschland ansässigen Plattform der EU. Die Daten von GISAID und von anderen Datenbanken werden außerdem in PANGO Lineages gesammelt, die von drei britischen und einer australischen Universität gewartet wird. Zum Team gehört Andrew Rambaut von der University of Edinburgh, der schon im Juli 2020 eine klar strukturierte Katalogisierung forderte.
PANGO stellt wirklich sehr ansprechend in Form von Tabellen und Grafiken tagesaktuell (!) dar, wo die jeweilige Variante entstand, wie sie sich von dort aus verbreitete und mit welcher Frequenz man sie wo findet. Da kann man z.B. nachlesen, dass man im Frühjahr die Variante D614G entdeckte. Sie entpuppte sich zwar nicht als gefährlicher, aber infektiöser als bisher vorherrschende Genotypen und verdrängte diese sehr rasch. Im Sommer 2020 entstand in Spanien die Variante B.1.177 mit der Mutation A222V. Sie ersetzte in Spanien D614G innerhalb weniger Monate, breitete sich von dort über Zentraleuropa bis Island aus und diversifizierte sich weiter. Es ist unklar, ob die schnelle Verbreitung auf eine erhöhte Infektiosität oder auf die Urlaubssaison mit starker Reisetätigkeit zurückzuführen ist.
Beunruhigende Viruslinien
PANGO führt auch eine Rubrik namens „Lineages of Concern“. Hier ist B.1.1.7 gelistet – übrigens bitte nicht verwechseln mit oben genannter B.1.177. B.1.1.7 enthält zwei bedeutsame Veränderungen im S-Protein: N501Y, die das Virus infektiöser macht, sowie E484K, welche die Wirkung neutralisierender Antikörper verringert. Möglicherweise ist diese Virusvariante auch gefährlicher als bisherige Linien. Es wurde (Stand: 8. März) in 94 Ländern nachgewiesen. Diese Variante wurde ziemlich sicher von Land zu Land weitergegeben und ist nicht mehrfach neu entstanden (BioRxiv, DOI: 10.1101/2021.01.12.426373, der Preprint ist allerdings wegen Klärung der Autorenschaft aktuell zurückgezogen).
PANGO verzeichnet auch die „Südafrika-Variante“ B.1.351 als „Lineage of Concern“. Auch sie enthält N501Y und E484K sowie neu die Mutation K417N. Die Kombination von N501Y und K417N im S-Protein verhindert wohl die Bindung von Antikörpern (BioRxiv, DOI: 10.1101/2020.12.23.424283). Innerhalb weniger Wochen wurde B.1.351 zur dominanten Variante am Horn (MedRxiv, DOI: 10.1101/2020.12.21.20248640). Sie machte sich ebenfalls auf die Reise rund um die Welt. In Brasilien trat die Variante B.1.1.28 (früher P.1) auf. Auch sie gilt ihrer Mutationen wegen als „Lineage of Concern“.
Achtung, neue Gefahr!
PANGO klassifiziert zwei weitere Varianten als „Lineages of Note“: A.23.1, erstmals in Uganda gefunden und dort heute dominant, sowie B1.525, in Nigeria entdeckt, heute aber auch in europäischen Ländern zu finden. Auch in Deutschland.
Karin Hollricher
Bild: PANGO lineages
Dieser Text basiert auf Karin Hollrichers Artikel „Corona-Mutationen: Wie sich das SARS-CoV-2-Virus verändert“, zuerst erschienen auf www.vfa.de.
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